体温35.4°C并伴有头疼，可能是由以下原因引起的：
1.正常的生理现象：有些人的基础体温可能偏低，尤其是在寒冷环境下或长时间处于低代谢状态时，可能会出现体温35.4°C并伴有头疼。此外，女性在生理期或怀孕期间，体温也可能略有波动。
2.药物副作用：某些药物，如抗抑郁药、降压药、抗组胺药等，可能会导致体温降低和头疼。
3.感染：病毒、细菌或其他感染可能引起体温升高，但在某些情况下，体温可能不高，甚至偏低，同时伴有头疼。
4.神经系统问题：头疼可能是神经系统问题的表现，如偏头痛、紧张性头痛等。
5.其他因素：低血糖、贫血、甲状腺功能减退等健康问题也可能导致体温偏低和头疼。
需要注意的是，以上只是一些可能的原因，具体情况需要进一步评估。如果头疼持续不缓解或伴有其他症状，如恶心、呕吐、发热、颈部僵硬等，应及时就医。医生会进行详细的身体检查、询问病史，并可能会建议进行进一步的检查，如血液检查、头部影像学检查等，以确定病因并制定相应的治疗方案。
此外，在日常生活中，保持良好的生活习惯也有助于预防体温偏低和头疼的发生，如合理饮食、适量运动、充足睡眠、避免过度劳累和压力等。如果对自己的健康状况有任何疑虑，最好咨询医生的建议。