体温35.4℃且头疼可能由多种原因引起。比如环境因素，在寒冷环境中停留过久，身体散热增加，可能导致体温偏低并引发头疼。另外，某些疾病也可能导致这种情况，像甲状腺功能减退症，患者甲状腺激素分泌不足，新陈代谢减缓，会出现体温偏低伴头疼的表现。还有可能是服用某些药物的副作用，比如过量使用退烧药等，也可能引起体温偏低和头疼。
环境因素影响
寒冷环境暴露：如果长时间处于温度低于20℃的环境中，人体散热加快，体温可能会下降到35.4℃左右，同时寒冷刺激头部血管收缩，就容易引发头疼。一般在温暖环境中休息一段时间，体温会逐渐回升，头疼也会缓解。保暖不当：比如穿得过少、盖的被子太薄等，夜间睡眠时保暖不够，也可能出现体温偏低伴头疼，及时增添衣物、盖厚被子后，情况通常能改善。
疾病相关情况
甲状腺功能减退症：甲状腺激素能调节机体代谢，当甲状腺功能减退时，机体代谢率降低，产热减少，可使体温低于正常范围，同时甲状腺激素缺乏还会影响神经系统功能，导致头疼。这类患者除了体温低、头疼，还可能有乏力、怕冷、皮肤干燥等表现。颅内感染性疾病：像脑膜炎等颅内感染，早期可能出现体温偏低（部分患者）伴头疼，同时可能伴有恶心、呕吐等症状。需要通过脑脊液检查等明确诊断。
药物副作用方面
退烧药过量：比如对乙酰氨基酚等退烧药，如果服用剂量超过正常范围，可能导致体温过低，同时药物副作用也可能引起头疼。一般在停止过量服用退烧药后，体温会逐渐恢复，头疼也会减轻，但要注意观察身体变化。其他药物影响：一些抗精神病药物等也可能有导致体温调节异常和头疼的副作用，用药期间出现这种情况需及时咨询医生调整用药。