克林霉素和头孢不能简单说哪个效果好，要根据感染的病菌类型等情况来定。一般来说，头孢对革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌等多种病菌有作用，而克林霉素对厌氧菌等有较好效果。
抗菌谱方面
头孢类药物：头孢涵盖了很多种类，像头孢唑林主要对革兰阳性菌有较好的抗菌作用，比如金黄色葡萄球菌等；而头孢他啶对铜绿假单胞菌等革兰阴性菌有较强的抗菌活性，能在很多由革兰阴性菌引起的感染中发挥作用，临床应用中针对肺炎、尿路感染等由不同病菌导致的感染都可能用到头孢类药物。克林霉素：主要对厌氧菌有很好的抗菌效果，比如脆弱拟杆菌等厌氧菌引起的腹腔感染、盆腔感染等情况，克林霉素就比较适用。同时对部分革兰阳性菌也有作用，像金黄色葡萄球菌（对克林霉素敏感的菌株）等引起的感染也可以用克林霉素。
适用感染类型差异
头孢适用情况：如果是呼吸道感染中由肺炎链球菌等革兰阳性菌引起的肺炎，或者是尿路感染中由大肠埃希菌等革兰阴性菌导致的膀胱炎等，头孢类药物常常被选用。例如社区获得性肺炎，很多时候会根据病情选择合适的头孢菌素进行治疗。克林霉素适用情况：当出现牙周脓肿这种由厌氧菌感染引起的情况时，克林霉素就比较合适。还有像女性盆腔炎中如果有厌氧菌参与感染，克林霉素联合其他药物使用也较为常见。
不良反应有别
头孢类常见不良反应：可能会引起过敏反应，轻的是皮疹等，严重的会出现过敏性休克；也可能有胃肠道反应，比如恶心、呕吐等；长期使用头孢类药物还可能导致肠道菌群失调等。不同代的头孢菌素不良反应有差异，比如第一代头孢可能对肾脏有一定的潜在影响。克林霉素常见不良反应：胃肠道反应相对比较常见，像口服克林霉素可能会引起恶心、呕吐、腹痛、腹泻等；也可能引起假膜性肠炎，这是比较严重的不良反应；还可能有过敏反应等情况。