肚子疼在医学上称为腹痛，大便时肚子疼可能与多种因素有关，以下是一些可能的原因：
1.肠道疾病：
炎症性肠病：如溃疡性结肠炎和克罗恩病，可导致肠道炎症和溃疡，引起腹痛和腹泻。
肠易激综合征：这是一种常见的功能性肠道疾病，常伴有腹痛、腹胀、便秘或腹泻等症状。
感染性肠炎：如细菌、病毒或寄生虫感染，可引起肠道炎症和腹痛。
肠道肿瘤：结肠癌、直肠癌等肠道肿瘤也可能导致腹痛。
2.其他腹部疾病：
肠梗阻：肠道堵塞可导致腹痛、呕吐和停止排气排便。
阑尾炎：阑尾发炎可引起转移性右下腹疼痛。
胆囊炎、胰腺炎：这些疾病可导致上腹部疼痛，有时可放射至背部。
腹部血管病变：如肠系膜血管栓塞或动脉粥样硬化，可引起腹痛。
3.肛肠疾病：
肛裂：肛门周围皮肤或肛管裂伤可引起疼痛。
痔疮：内痔或外痔可能导致肛门疼痛或不适感。
肛瘘：肛管或直肠与肛周皮肤之间的瘘管可引起疼痛和流脓。
4.全身性疾病：
内分泌疾病：如糖尿病酮症酸中毒、甲状腺功能亢进等，可引起腹痛。
结缔组织病：如系统性红斑狼疮、类风湿关节炎等，可累及肠道和腹部其他器官，导致腹痛。
药物副作用：某些药物可能引起胃肠道不适和腹痛。
需要注意的是，大便时肚子疼还可能有其他原因。对于长期或频繁出现的腹痛，尤其是伴有其他症状如发热、呕吐、腹泻、血便、消瘦等，应及时就医，进行详细的身体检查、实验室检查和影像学检查，以明确病因并采取适当的治疗措施。
对于特殊人群，如孕妇、老年人、有慢性疾病的患者等，大便时肚子疼可能需要特别关注。在这些情况下，应尽快咨询医生，以确保自身和胎儿的健康。
此外，保持良好的饮食习惯、避免过度进食、减少刺激性食物的摄入、保持规律的排便习惯等，有助于预防和缓解腹痛。如果腹痛持续不缓解或加重，应及时就医。