卵巢囊肿可以通过多种检查方法来确诊，常见的检查方式包括超声检查、肿瘤标志物检查以及腹腔镜检查等。一般来说，超声检查是初步筛查卵巢囊肿常用且重要的方法，经阴道超声检查对于卵巢囊肿的检出较为敏感，能发现较小的囊肿。
超声检查：初步筛查的常用手段
经腹部超声检查： 检查时需要患者憋尿，使膀胱充盈，从而推开肠管，清晰显示盆腔内的卵巢情况。这种检查可以初步判断卵巢囊肿的大小、形态、囊实性等。一般在怀孕早期也会通过超声检查来观察是否有卵巢囊肿等情况。经阴道超声检查： 不需要憋尿，而且探头距离卵巢更近，能更清晰地显示卵巢及囊肿的细节。对于直径小于1厘米的囊肿也有可能发现，在判断囊肿的性质方面有一定优势，比如能更好地区分囊肿是单纯性还是复杂性等。
肿瘤标志物检查：辅助判断囊肿性质
CA125： 如果卵巢囊肿是恶性的，CA125（癌抗原125）可能会升高。但CA125升高并不一定就是卵巢癌，一些良性疾病如盆腔炎等也可能导致其轻度升高。一般来说，CA125的正常参考值范围是血清＜35U/mL，如果检查发现CA125明显升高，结合超声等检查结果，需要进一步排查卵巢恶性肿瘤的可能。HE4（人附睾蛋白4）： 也是一种辅助判断卵巢肿瘤的标志物，在卵巢癌的诊断中与CA125联合检测可以提高准确性。HE4水平升高结合超声等检查，对卵巢癌的早期诊断有一定帮助。
腹腔镜检查：直观诊断与治疗
诊断作用： 腹腔镜检查是一种有创的检查方法，但可以直接观察卵巢的外观、囊肿的情况，还能对可疑的病变进行活检，从而明确卵巢囊肿的性质。比如可以看到囊肿是单侧还是双侧，囊肿的表面情况等，对于判断是良性还是恶性囊肿有重要意义。一般在其他检查不能明确卵巢囊肿性质，需要进一步确诊时会考虑进行腹腔镜检查。治疗作用： 同时，腹腔镜检查也可以在明确诊断的同时进行相应的治疗，比如对于一些良性的卵巢囊肿可以在腹腔镜下进行切除等操作。不过腹腔镜检查属于有创操作，会有一定的风险，如出血、感染等，但相对来说创伤较小，恢复较快。