先天性胆总管囊肿要做的检查主要包括B型超声检查、磁共振胰胆管成像（MRCP）、逆行胰胆管造影（ERCP）和经皮肝穿刺胆管造影（PTC）等。具体如下：
1.B型超声检查：可显示肝内外胆管扩张情况，有助于诊断先天性胆总管囊肿。
2.MRCP：是一种非侵入性的检查方法，可清晰显示胆道系统的全貌，对诊断先天性胆总管囊肿具有重要价值。
3.ERCP：通过十二指肠镜逆行插管至胆总管，注入造影剂后进行X线摄片，可了解胆总管及胆囊的形态、大小和位置，同时还可进行乳头括约肌切开取石等治疗。
4.PTC：在X线引导下经皮经肝穿刺胆管造影，可了解肝内外胆管的情况，对诊断和治疗有一定的帮助。
此外，血常规、肝功能等检查也有助于评估患者的整体情况。
需要注意的是，具体的检查项目应根据患者的病情和医生的建议进行选择。在检查前，患者应详细告知医生自己的病史和症状，以便医生做出准确的诊断和治疗方案。