HPV16阳性的治疗需要根据具体情况来定，一般来说，大部分免疫力正常的女性感染HPV16后，可通过自身免疫力在1年左右清除病毒，但也有少部分会持续感染进而引发病变。
自身免疫清除
对于大部分免疫力正常的人，尤其是年轻女性，约80%的HPV16感染可在1年内靠自身免疫系统清除。这时候要注意保持良好的生活习惯，保证充足睡眠，每天尽量保证7-8小时的高质量睡眠，同时要均衡饮食，多摄入富含维生素、蛋白质的食物，像新鲜的蔬菜水果、牛奶、鸡蛋等，让身体有良好的营养基础来增强免疫力。
医学干预情况
存在宫颈病变时
如果HPV16阳性且伴有宫颈上皮内瘤变等病变，就需要进行医学干预。比如宫颈低度病变，可定期复查，每6-12个月进行一次TCT（液基薄层细胞学检测）和HPV检测，观察病变的发展情况。要是宫颈高度病变，可能需要进行物理治疗，像激光治疗，通过激光的能量破坏病变组织，促进正常组织修复。
持续高危型感染
当HPV16持续感染超过1年，或者合并其他不良因素时，可能需要使用一些药物辅助清除病毒，比如干扰素类药物，它可以调节机体免疫功能，帮助增强身体对HPV病毒的清除能力，但药物使用需在医生指导下进行，不能自行随意用药。
生活注意事项
感染HPV16后要避免高危性行为，性生活时正确使用避孕套可以降低病毒传播风险。同时要注意个人卫生，保持外阴清洁，但不要过度清洗阴道，以免破坏阴道正常菌群平衡。还要避免吸烟，吸烟会影响机体免疫力，不利于HPV病毒的清除，有吸烟习惯的人要努力戒烟。