会厌囊肿是否需要手术以及手术的最佳时间，需要根据具体情况来决定。一般来说，以下情况需要手术：
1.会厌囊肿较大，已经引起明显的喉部堵塞感、异物感、吞咽或呼吸困难等症状。
2.会厌囊肿反复感染，导致喉部疼痛、发热、吞咽困难等症状。
3.会厌囊肿怀疑有恶变倾向。
对于需要手术的会厌囊肿，手术的最佳时间一般在囊肿较小、症状较轻时进行，这样可以减少手术的难度和风险，同时也有利于术后恢复。如果囊肿已经较大或症状较严重，手术难度和风险会相应增加，术后恢复也可能会受到影响。
需要注意的是，手术治疗会厌囊肿只是一种对症治疗方法，术后还需要注意喉部的护理和保养，避免吸烟、饮酒、过度用嗓等刺激，以预防囊肿的复发。
总之，会厌囊肿手术的最佳时间需要根据患者的具体情况来决定，建议在医生的指导下进行治疗。