糖尿病肾病的鉴别诊断需要综合多方面来进行。糖尿病肾病是糖尿病常见的微血管并发症之一，在诊断时要与其他可能导致类似肾脏病变的疾病区分开。一般来说，糖尿病肾病的鉴别诊断可以从以下几个方面入手。
与原发性肾小球疾病鉴别
原发性肾小球肾炎： 原发性肾小球肾炎中的慢性肾小球肾炎，可能会出现蛋白尿、水肿等类似糖尿病肾病的表现。但原发性肾小球肾炎患者一般没有糖尿病病史，通过详细询问病史可以初步区分。例如，原发性肾小球肾炎患者的尿常规检查除了蛋白尿，可能还会有血尿等其他异常，而糖尿病肾病早期主要以微量白蛋白尿为主。膜性肾病： 膜性肾病也可表现为蛋白尿，需要与糖尿病肾病相鉴别。膜性肾病患者的血清学检查可能会有一些特定指标异常，如抗磷脂酶A2受体抗体等，而糖尿病肾病患者有明确的糖尿病病史，且通过肾活检病理检查也有其特征性表现，膜性肾病的病理表现主要是肾小球基底膜上皮侧免疫复合物沉积等，与糖尿病肾病的病理表现不同。
与高血压肾损害鉴别
高血压肾损害： 长期高血压也会导致肾脏损害，称为高血压肾损害。高血压肾损害患者有长期高血压病史，一般高血压病史在10年以上可能更容易出现肾损害。而糖尿病肾病患者有糖尿病病史，且糖尿病肾病的蛋白尿出现时间相对有一定特点，早期多为微量白蛋白尿，随着病情进展才出现大量蛋白尿。另外，高血压肾损害的肾活检病理表现主要是肾小动脉硬化等，与糖尿病肾病的病理改变不同。恶性高血压肾硬化： 恶性高血压肾硬化病情进展迅速，患者会有急剧升高的血压，同时肾脏损害表现明显，如短期内出现少尿、肾功能急剧恶化等，而糖尿病肾病进展相对缓慢，有其自身糖尿病相关的发展过程，通过病史和病情进展速度等可以辅助鉴别。
与其他继发性肾病鉴别
狼疮性肾炎： 系统性红斑狼疮患者可出现狼疮性肾炎，表现为蛋白尿等肾脏损害。狼疮性肾炎患者多见于女性，有全身多系统受累的表现，如面部红斑、关节痛、口腔溃疡等，实验室检查可发现自身抗体阳性，如抗核抗体、抗双链DNA抗体等阳性，而糖尿病肾病患者没有这些自身免疫相关的异常表现，可借此鉴别。紫癜性肾炎： 过敏性紫癜患者出现的紫癜性肾炎，患者有过敏性紫癜的典型表现，如皮肤紫癜、关节痛、腹痛等，而糖尿病肾病患者没有这些表现，通过病史和临床表现可以进行初步鉴别。