5岁孩子发烧39度属于高热，需及时采取措施降温，可先通过物理降温配合适当药物辅助等方式来处理。
物理降温方法
可以用温水擦拭孩子的额头、颈部、腋窝、腹股沟等部位，这些部位血管丰富，有助于散热。注意水温不宜过凉，避免孩子不适。另外，让孩子多喝些温水，补充因发热散失的水分，也利于降温。
药物辅助降温
若物理降温效果不佳，可在医生指导下使用退烧药，如对乙酰氨基酚等，但要严格遵循儿科用药原则，根据孩子体重等情况合理选择。
观察孩子状况
密切观察孩子的精神状态、有无其他伴随症状，如咳嗽、呕吐、腹泻等。如果孩子出现精神萎靡、抽搐等异常情况，需立即送往医院就诊。
保持适宜环境
将室内温度保持在22 - 25摄氏度左右，湿度维持在50% - 60%，让孩子处于一个舒适的环境中，有利于身体恢复。同时给孩子穿着宽松、透气的衣物，便于散热。