当5岁孩子发烧39度时，以下是一些建议的步骤来处理：
1.测量体温：使用体温计测量孩子的体温，确保测量准确。如果体温确实为39度，属于高烧。
2.采取退烧措施：
给孩子服用退烧药，按照药品说明书的剂量和使用方法进行。可以选择儿童专用的退烧药，如对乙酰氨基酚或布洛芬。
给孩子多喝水，以帮助降低体温并防止脱水。
脱掉过多的衣物，保持孩子舒适，但不要让孩子着凉。
用温水擦拭孩子的身体，尤其是手心、脚心、腋窝和腹股沟等部位，帮助散热。
3.观察孩子的状况：密切观察孩子的状况，包括体温变化、精神状态、呼吸情况等。如果孩子出现以下情况，需要及时就医：
体温持续升高或不降。
孩子出现意识不清、抽搐、呼吸困难等异常症状。
孩子年龄较小或有其他健康问题。
4.就医咨询：如果孩子的发烧持续时间较长、体温较高或出现其他异常症状，最好咨询医生的意见。医生可以根据孩子的具体情况进行进一步的诊断和治疗建议。
需要注意的是，以上步骤仅为一般情况下的处理建议。每个孩子的情况可能不同，因此在采取任何措施之前，最好先咨询医生或专业医疗人员的建议。此外，定期给孩子进行预防接种、保持良好的卫生习惯和生活环境也有助于预防感染和减少发热的发生。