疱疹性咽炎一般具有自限性，因此主要以对症治疗为主，缓解患儿的不适症状。同时，需要注意保持口腔清洁，避免继发感染。如果患儿出现高热，可给予退烧药，如布洛芬或对乙酰氨基酚；如果患儿咽痛明显，可给予口腔局部喷雾，如利巴韦林气雾剂、开喉剑喷雾剂等；如果患儿出现精神萎靡、嗜睡、呕吐等症状，可能是并发了脑炎，需要及时就医，进行抗病毒、脱水降颅压等治疗。
在治疗期间，患儿需要注意休息，多喝水，饮食以清淡、易消化为主，避免食用辛辣、刺激性食物。同时，需要注意保持口腔清洁，饭后可用淡盐水漱口。患儿的餐具、玩具等需要定期消毒，避免交叉感染。
需要注意的是，疱疹性咽炎的症状与手足口病相似，但手足口病除了口腔疱疹外，还可在手、足、臀部等部位出现皮疹。如果患儿同时出现皮疹，需要及时就医，明确诊断。此外，疱疹性咽炎也可能与其他病原体感染有关，如细菌、支原体等，如果患儿症状持续不缓解或出现加重，需要及时就医，明确病因，进行针对性治疗。