肠穿孔是一种较为严重的急腹症，若不及时处理，会带来诸多危险。肠穿孔后，肠道内的内容物会漏入腹腔，引发严重的腹腔感染，若感染未能得到有效控制，可能在数小时至数天内就会出现感染性休克，有数据显示，约10% - 20%的肠穿孔患者会在发病后短期内发展为感染性休克。
引发严重腹腔感染
炎症扩散迅速： 肠道内含有大量细菌等微生物，肠穿孔后这些内容物进入腹腔，会迅速引发腹膜炎。患者会出现剧烈腹痛，疼痛程度较为严重，且呈持续性，还可能伴有腹胀、恶心、呕吐等症状。随着炎症的发展，体温会明显升高，一般可达到38℃以上，严重时甚至会超过39℃ - 40℃。感染难以控制： 腹腔感染如果得不到及时有效的治疗，感染会不断扩散，可能波及整个腹腔，导致全腹膜炎。而且感染还可能通过血液循环传播到全身其他部位，引起脓毒血症等更严重的情况，进一步加重病情。
影响肠道功能及全身状态
肠道蠕动紊乱： 肠穿孔会破坏肠道正常的解剖结构和生理功能，导致肠道蠕动紊乱。患者原本规律的肠道蠕动受到干扰，可能出现肠梗阻的表现，如停止排气排便、腹痛加剧且呈阵发性绞痛等。同时，肠道对营养物质的消化吸收功能也会受到严重影响，患者会出现营养不良的情况，体重逐渐下降，身体抵抗力也会随之降低。导致水电解质紊乱： 由于肠穿孔后患者出现恶心、呕吐、腹痛等症状，会导致大量体液丢失，同时肠道丢失大量消化液，容易引起水电解质紊乱。比如会出现低钾血症，患者表现为乏力、四肢软弱无力，严重时可影响心脏功能；还可能出现代谢性酸中毒，表现为呼吸深快等。
增加治疗难度和风险
手术难度加大： 肠穿孔时间越长，腹腔感染越严重，手术难度就越大。因为腹腔内炎症明显，组织粘连严重，解剖结构不清，手术操作会更加困难，容易损伤周围脏器，增加手术并发症的发生几率。例如，可能会损伤肠管周围的血管，导致术中大出血；或者损伤输尿管等其他重要脏器。术后恢复缓慢： 即使经过手术治疗，由于术前腹腔感染严重，患者术后恢复也会比较缓慢。术后可能会出现切口感染、腹腔残余感染等并发症，延长住院时间。而且患者身体恢复需要较长时间，可能会影响日常生活和工作，部分患者还可能留下慢性腹痛等后遗症。