发烧39度一会冷一会热，可能是感染、自身免疫性疾病等原因引起。可以采取以下措施。
1.就医检查：发冷和发热交替出现，可能是感染性疾病的表现，如细菌、病毒、真菌等感染。此外，自身免疫性疾病、恶性肿瘤等也可能导致发热。需要及时就医，进行相关检查，如血常规、C反应蛋白、自身抗体检测、影像学检查等，以明确病因。
2.药物治疗：根据病因和症状，医生会给予相应的药物治疗。如果是感染引起的发热，可能会使用抗生素、抗病毒药物或抗真菌药物等。如果是自身免疫性疾病，可能会使用免疫抑制剂或糖皮质激素等药物。此外，还可能会使用退烧药，如对乙酰氨基酚或布洛芬，来缓解发热和发冷的症状。
3.补充水分：发热会导致身体水分流失，需要及时补充水分。可以多喝水，也可以选择口服补液盐溶液，以维持身体的水分平衡。
4.注意休息：发热时身体需要更多的能量来对抗病原体，因此需要保证充足的休息。避免过度劳累，保持良好的睡眠。
5.物理降温：可以采用物理降温的方法来缓解发热和发冷的症状。如用温水擦拭身体、使用冰袋敷额头、腋窝等部位。但要注意避免过度降温，尤其是老年人和儿童。
6.监测体温：密切监测体温变化，记录体温的峰值和持续时间。如果体温持续升高或出现其他异常症状，应及时告知医生。
7.避免捂汗：在发热时，避免过度捂汗，以免影响散热。穿着宽松、透气的衣物，保持室内空气流通。
8.饮食调整：选择易消化、富含营养的食物，如粥、面条、蔬菜、水果等，以补充身体所需的能量和营养。
需要注意的是，对于特殊人群，如孕妇、儿童、老年人或患有基础疾病的人群，发热可能会带来更大的风险。因此，如果出现发烧39度一会冷一会热的症状，应尽快就医，遵循医生的建议进行治疗。同时，要密切观察病情变化，如有异常应及时告知医生。