便后手纸有血伴肛门疼痛，可能是以下原因引起：
1.肛裂：
肛裂是肛管皮肤全层裂伤后形成的感染性溃疡，典型表现为肛门疼痛、便血和便秘。初期肛管皮肤纵行裂口，呈线形或棱形，色红，底浅有弹性，触痛明显。晚期裂口纤维化，肛管变窄，排便时易导致肛门括约肌痉挛，产生疼痛，导致便后手纸有血伴肛门疼痛。
2.内痔：
内痔是肛垫的支持结构、血管丛及动静脉吻合支发生病理性改变或移位。内痔一般无疼痛，以便血、痔核脱出为主要症状，严重时会出现喷射状出血，血色鲜红，排便后会自行停止。内痔发展到后期，排便时会刺激内痔的痔核，导致痔核脱出，从而引起便后手纸有血伴肛门疼痛。
3.肛管或直肠下段肿瘤：
肛管或直肠下段的良性肿瘤或恶性肿瘤，如肛管或直肠下段的息肉、乳头状瘤、黑色素瘤、肛管直肠癌等，也会导致便后手纸有血伴肛门疼痛。
4.其他：
肛管或直肠的损伤、肛门直肠周围脓肿、溃疡性结肠炎、克罗恩病、肠结核、艾滋病等，也会出现便后手纸有血伴肛门疼痛的症状。
如果出现便后手纸有血伴肛门疼痛的症状，建议及时就医，进行相关检查，如肛门指诊、肛门镜检查、结肠镜检查等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，在日常生活中，应注意保持肛门清洁，避免久坐、久站，保持大便通畅，避免食用辛辣刺激性食物等。