宝宝咳嗽有痰是否会自愈需分情况而论。
轻微病毒性感冒引起的咳嗽有痰
若宝宝因轻微病毒性感冒出现咳嗽有痰，且一般情况良好，免疫力正常，通常有自愈可能。因为人体自身免疫系统有一定抵御能力，经过几天到一周左右，机体可逐渐清除病毒，咳嗽有痰症状会慢慢缓解消失。但要密切观察宝宝状态，若症状无改善甚至加重需及时就医。
过敏因素导致的咳嗽有痰
如果是过敏引起的宝宝咳嗽有痰，如接触花粉、尘螨等过敏原，若不脱离过敏原，一般不会自愈。需让宝宝远离过敏原，必要时就医进行抗过敏等处理，否则咳嗽有痰会持续存在甚至加重。
细菌感染引发的咳嗽有痰
由细菌感染导致的宝宝咳嗽有痰，如支气管炎、肺炎等情况，通常不会自愈。细菌感染不会靠宝宝自身轻易消除，若不干预，病情可能加重，出现发热、呼吸急促等更严重表现，需就医进行抗感染等治疗。
特殊疾病导致的咳嗽有痰
一些特殊疾病，像先天性呼吸道畸形等引起的宝宝咳嗽有痰，肯定不会自愈，需及时就医进行相应的医学干预，如手术等治疗措施来解决根本问题。