咳嗽时肚子痛通常是因为咳嗽过程中腹部肌肉频繁收缩、震动，导致腹部肌肉疲劳或拉伤，或是剧烈咳嗽引起腹腔内压力短时间大幅变化，刺激腹腔内相关神经等所致。
一、肌肉频繁收缩引发
咳嗽是胸部和腹部肌肉协同参与的动作，剧烈或频繁咳嗽时，腹部肌肉持续收缩，长时间高强度收缩会使肌肉产生乳酸等代谢产物堆积，引发酸痛，尤其本身腹部肌肉力量较弱者更易出现。
二、腹腔压力变化刺激
剧烈咳嗽会让腹腔内压力急剧升高，这种压力变化可能刺激到腹腔内的脏器包膜、神经等结构，从而传导至腹部产生痛感，比如有基础胃肠道疾病者，压力变化可能加重不适。
三、原有腹部疾病影响
若本身有阑尾炎、胆囊炎等腹部疾病，咳嗽时腹腔压力改变及肌肉震动会加重病灶处的刺激，进而引发肚子痛，不同基础疾病引发的疼痛特点等有差异。
四、特殊人群情况
儿童咳嗽时肚子痛可能是因为儿童腹部肌肉、神经等发育尚不完善，咳嗽时更易受影响；老年人可能本身有肌肉劳损、脏器功能衰退等情况，咳嗽肚子痛相对更易发生，且恢复可能较慢，需多关注休息等情况。