卵巢囊肿是否会自行消失，取决于囊肿的性质。一般来说，有以下几种情况：
1.功能性囊肿：这类囊肿可能是滤泡囊肿或黄体囊肿，多为单侧，直径一般不超过5厘米，通常会在月经来潮后自行消失，无需特殊处理。
2.单纯性囊肿：直径小于5厘米的单纯性囊肿，可能是生理性的，也可能是良性的。有部分患者在3个月至6个月内会自行消失。如果囊肿持续存在或长大，或出现腹痛、阴道流血等异常症状，需要进一步检查和治疗。
3.赘生性囊肿：包括浆液性囊腺瘤、黏液性囊腺瘤、巧克力囊肿等，一般不会自行消失。如果囊肿较大、有恶变倾向或引起明显症状，需要手术治疗。
4.其他：如卵巢子宫内膜异位囊肿（巧克力囊肿），也不会自行消失，还可能逐渐增大，导致痛经、性交痛、不孕等问题。
需要注意的是，卵巢囊肿的诊断需要结合临床症状、体征、实验室检查和影像学检查等综合判断。对于疑似卵巢囊肿的患者，应及时就医，医生会根据具体情况制定合适的治疗方案。此外，定期复查也是非常重要的，以便及时发现囊肿的变化，采取相应的措施。
总之，大多数卵巢囊肿可能会自行消失，但也有一些囊肿需要积极治疗。患者应遵循医生的建议，进行定期检查和随访。