佝偻病若未及时有效治疗，可能留下多种后遗症。
骨骼畸形
病情较重或病程较长的患儿，会出现骨骼畸形，比如鸡胸，表现为胸骨向前突出，形似鸡的胸脯；还有O型腿或X型腿，影响肢体外观与运动功能，这是因为佝偻病导致骨骼生长发育异常，钙磷代谢紊乱，影响骨骼正常形态构建。
运动功能发育迟缓
由于骨骼病变，患儿运动功能发育会受影响，可能出现行走延迟等情况，相比正常儿童，学步时间明显推后，这是因为骨骼畸形或强度不足，限制了患儿的运动能力发展。
呼吸功能受影响
严重的鸡胸等胸廓畸形会影响胸腔容积，进而影响呼吸功能，使患儿呼吸浅快，活动耐力下降，在进行轻微活动时就可能出现气喘等表现，是因为胸廓形态改变，限制了肺部的正常扩张与收缩。
心理影响
骨骼畸形可能会对患儿的心理产生影响，尤其是年龄稍大开始关注自身外观的儿童，可能会产生自卑等心理问题，这与患儿因外观异常可能受到的他人评价等因素相关，需要家长及社会给予更多的心理关怀与引导。