三个月宝宝咳嗽有痰，可采取以下措施。
首先，保持适宜的环境温度和湿度。可以使用加湿器增加空气湿度，有助于缓解咳嗽和祛痰。
其次，经常给宝宝拍背。让宝宝侧卧或抱起侧卧，家长五指微曲成半环状，即空心拳，然后轻轻拍打宝宝的前胸及侧胸背部，两侧交替进行，拍背力量不宜过大，由上而下，从外向内，依次进行。拍背能促使宝宝肺部和支气管内的痰液松动，向大气管引流并排出，从而改善症状。
此外，还可以多给宝宝喂水。宝宝咳嗽时，气道会变得干燥，多喝水有助于保持呼吸道湿润，促进痰液咳出。
如果咳嗽和痰鸣较为严重，或出现呼吸急促、发热等症状，应及时就医。医生可能会根据具体情况给予药物治疗，如祛痰药、止咳药等。
需要注意的是，三个月以下的宝宝咳嗽有痰，应及时就医，因为他们的咳嗽反射尚未完全发育，无法有效咳出痰液，容易导致痰液积聚，引发肺炎等并发症。同时，在就医过程中，应如实告知医生宝宝的症状、喂养情况和家族病史等，以便医生做出准确的诊断和治疗。
此外，对于有过敏体质的宝宝，咳嗽有痰可能与过敏有关，如过敏性鼻炎、咳嗽变异性哮喘等。在这种情况下，可能需要进一步检查和治疗。
总之，三个月宝宝咳嗽有痰时，家长应密切观察宝宝的症状变化，保持适宜的环境，采取适当的护理措施，并在需要时及时就医。同时，遵循医生的建议进行治疗，确保宝宝的健康。