嗓子疼高烧39度时，首先要采取降温措施，比如可以用湿毛巾擦拭额头、腋窝等部位进行物理降温，同时尽快就医明确病因进行针对性治疗。
如何进行物理降温
温水擦浴： 可以用32~34℃的温水擦拭颈部、腋窝、腹股沟等大血管丰富的部位，每次擦拭时间10分钟以上，通过水分蒸发帮助散热，能使体温有一定程度的下降。注意事项： 擦浴时要注意保暖，避免受凉，而且皮肤有破损的地方不宜擦浴。
就医前的初步处理
多喝温水： 发烧会使身体失水，多喝温水可以补充水分，防止脱水，还能促进新陈代谢，有助于体温下降。一般每天至少要喝1500~2000毫升的水。禁忌： 不要喝冰水，以免刺激胃肠道引起不适。使用退热贴： 退热贴贴在额头等部位，利用凝胶中水分的蒸发带走热量，起到辅助降温的作用，一般可以持续4~8小时发挥作用。
可能的病因及初步判断
上呼吸道感染： 除了嗓子疼、高烧39度外，还可能伴有咳嗽、鼻塞、流涕等症状。比如病毒性上呼吸道感染较为常见，往往具有一定的自限性，但也需要及时处理。细菌感染： 像化脓性扁桃体炎也会导致嗓子疼高烧，此时扁桃体可能会红肿、有脓性分泌物等表现，需要医生进一步通过血常规等检查来判断是否有细菌感染。
及时就医的重要性
明确诊断： 医生会通过详细的问诊、查体以及必要的辅助检查，如血常规、C - 反应蛋白等，准确判断嗓子疼高烧39度的具体病因，是病毒感染还是细菌感染等，从而制定更精准的治疗方案。避免延误病情： 如果是一些严重的疾病引起的嗓子疼高烧，比如猩红热等，及时就医才能早期干预，防止病情加重引发更严重的并发症，像风湿热、肾炎等。