怀孕40天流褐色分泌物可能是先兆流产、宫外孕或其他原因引起，需要及时就医，进行相关检查，如孕酮、人绒毛膜促性腺激素（β-HCG）、B超等，以明确原因，并采取相应的治疗措施。以下是一些建议：
1.及时就医：褐色分泌物可能是先兆流产、宫外孕等异常情况的表现，也可能是正常的孕期现象，但需要通过检查来确定。应尽快前往医院妇产科就诊，医生会根据具体情况进行评估和诊断。
2.配合检查：医生可能会建议进行一些检查，以了解胚胎的发育情况和排除其他潜在问题。这些检查包括孕酮、β-HCG测定、B超等。孕酮水平低可能提示先兆流产，B超可以确定孕囊的位置和大小，排除宫外孕的可能。
3.注意休息：在等待检查结果和治疗期间，应注意休息，避免过度劳累和剧烈运动。尽量卧床休息，减少活动，保持心情放松。
4.观察症状：除了褐色分泌物外，还应注意是否有腹痛、阴道流血增多等其他异常症状。如果出现这些症状，应及时告知医生。
5.遵循医生建议：医生会根据检查结果和你的具体情况制定治疗方案。可能的治疗措施包括卧床休息、补充孕激素、进行保胎治疗等。在治疗期间，要严格按照医生的建议进行，按时服药、复诊。
6.注意饮食和生活习惯：保持均衡的饮食，摄入富含蛋白质、维生素和矿物质的食物。避免吸烟、饮酒和接触有害物质。
7.心理支持：孕期出现褐色分泌物可能会让你感到焦虑和担心，与家人和朋友交流，寻求心理支持，也可以考虑咨询专业的心理咨询师。
需要注意的是，每个人的情况都不同，治疗方案也会因人而异。因此，在面对怀孕40天流褐色分泌物的情况时，应及时就医，遵循医生的建议进行治疗和护理。同时，保持良好的心态，对胎儿的健康发育也非常重要。如果对孕期的任何问题有疑问或担忧，应随时与医生沟通。