两侧基底节区腔隙性脑梗死的治疗方法包括以下几个方面：
1.药物治疗：
抗血小板药物：如阿司匹林、氯吡格雷等，可抑制血小板聚集，预防血栓形成。
他汀类药物：如阿托伐他汀、瑞舒伐他汀等，可降低血脂，稳定斑块。
改善脑循环药物：如丹参、川芎嗪等，可扩张脑血管，改善脑血液循环。
神经保护药物：如依达拉奉、胞磷胆碱等，可减轻脑损伤。
控制危险因素药物：如高血压患者需服用降压药控制血压，糖尿病患者需服用降糖药控制血糖等。
2.手术治疗：
颈动脉内膜切除术：适用于颈动脉狭窄导致脑梗死的患者，可通过手术去除颈动脉内的斑块，增加脑血流。
血管内介入治疗：如血管内溶栓、球囊扩张成形术等，可开通闭塞的血管。
3.康复治疗：
物理治疗：包括运动治疗、物理因子治疗等，可帮助患者恢复运动功能和日常生活能力。
语言治疗：针对语言障碍的患者，进行语言训练和康复治疗。
心理治疗：帮助患者调整心理状态，缓解焦虑、抑郁等情绪。
需要注意的是，两侧基底节区腔隙性脑梗死的治疗方法应根据患者的具体情况制定，包括年龄、健康状况、梗死面积和部位等因素。在治疗过程中，患者需要积极配合医生的治疗，同时注意饮食健康、戒烟限酒、控制血压和血糖等，以预防脑梗死的复发。此外，定期复查也是非常重要的，以便及时发现并处理可能出现的问题。如果对脑梗死的治疗有任何疑问，应及时咨询医生。