3个月宝宝喉咙有痰，可通过以下方法去除：
1.拍痰：将宝宝竖着抱起，拍背时由下往上，从外向内。空心掌可以稍用点力，有节奏地拍打，震动气道，使痰液松动并排出。每个肺叶要拍到，总时长约5分钟。一天拍2-3次即可。
2.适当喂水：如果是母乳喂养，妈妈饮食要注意，不要吃太油腻的食物。如果是配方奶喂养，可以适当增加喂水的次数。
3.调整室内湿度：使用加湿器等设备，将室内湿度调整到60%-70%，可以减轻宝宝喉咙的刺激，帮助痰液咳出。
4.及时就医：如果宝宝喉咙有痰的情况持续时间较长或伴有其他症状，如咳嗽、呼吸急促等，应及时就医，以确定是否存在感染等问题，并根据医生的建议进行治疗。
需要注意的是，对于3个月以下的宝宝，咳嗽反射还没有完全发育成熟，喉咙有痰时，可能不会通过咳嗽的方式将其排出。如果宝宝出现呼吸急促、喘息、吃奶呛咳等情况，应及时就医。