孕妇孕期三个月肚子疼可能由多种原因引起。一般来说，怀孕三个月时子宫逐渐增大，可能会引起生理性的牵拉痛，但也可能是一些异常情况导致。比如，宫外孕破裂可能会引起剧烈腹痛，伴有阴道出血；先兆流产也会出现肚子疼，可能伴有少量阴道流血。
生理性腹痛原因
子宫增大牵拉： 怀孕三个月时，子宫开始逐渐增大，会对周围的韧带、组织产生牵拉，从而引起轻微的肚子疼，这种疼痛一般比较轻微，呈间歇性，通常不伴有其他明显异常表现。激素变化影响： 孕期体内激素水平发生变化，会导致盆腔充血等情况，也可能引发肚子轻微不适，一般疼痛程度较轻，属于正常的生理反应。
病理性腹痛原因
宫外孕： 如果是宫外孕，除了肚子疼外，还可能伴有阴道不规则出血，腹痛多为一侧下腹部隐痛或酸胀感，若宫外孕发生破裂，会出现一侧下腹部撕裂样疼痛，同时可能伴有头晕、乏力甚至休克等表现。这种情况是比较危险的，需要及时就医处理。先兆流产： 先兆流产引起的肚子疼，往往是阵发性的下腹疼痛，同时可能有少量阴道流血。如果出现这种情况，孕妇需要卧床休息，及时到医院进行相关检查，如超声检查、血孕酮和人绒毛膜促性腺激素（hCG）测定等，必要时进行保胎治疗。肠道问题： 孕期孕妇的肠道功能可能会受到影响，如果吃了不洁食物或腹部着凉等，可能会引起肠道痉挛导致肚子疼，常伴有腹泻、恶心、呕吐等症状。不过这种情况相对宫外孕、先兆流产来说，一般腹痛程度相对较轻，但也需要引起重视，必要时就医处理。泌尿系统问题： 孕期子宫增大可能会压迫泌尿系统，引发泌尿系统感染等问题，也会导致肚子疼，同时可能伴有尿频、尿急、尿痛等症状。如果出现这些症状，需要及时就医，进行相关检查，如尿常规等，明确诊断后进行相应治疗。