扁桃体炎主要是由病原微生物感染引起，其中A组乙型溶血性链球菌是较为常见的致病菌，约10%-30%的扁桃体炎是由它导致的。
病原体感染因素
细菌感染： 除了A组乙型溶血性链球菌，葡萄球菌、肺炎链球菌等也可能引发扁桃体炎。比如肺炎链球菌引起的扁桃体炎，在儿童群体中相对多见，会导致扁桃体红肿、疼痛等症状。病毒感染： 像EB病毒、鼻病毒、腺病毒等病毒感染也能引起扁桃体炎。例如腺病毒引发的扁桃体炎，具有一定传染性，可通过飞沫或接触传播，在集体生活环境中容易造成聚集性发病。
自身抵抗力因素
免疫力低下时易发病： 当人体过度疲劳、营养不良、缺乏锻炼等情况出现时，自身免疫力会下降，此时就更容易受到病原体侵袭而患上扁桃体炎。比如长期熬夜的人，身体免疫力降低，相比作息规律的人，患扁桃体炎的几率会高一些。儿童免疫力特点： 儿童的免疫系统还未完全发育成熟，相比成年人更容易发生扁桃体炎。据统计，5-15岁的儿童扁桃体炎发病率相对较高，这是因为此阶段儿童免疫系统处于不断完善过程中，抵御病原体能力较弱。
环境因素影响
空气污染影响： 长期处于污染严重的环境中，空气中的有害颗粒、化学物质等会刺激扁桃体，降低扁桃体的防御能力，增加扁桃体炎发病风险。例如在工业污染严重的地区，居民患扁桃体炎的概率可能会比空气质量好的地区高。季节变化影响： 季节更替时气温变化较大，人体容易受凉，而受凉后呼吸道局部抵抗力下降，容易诱发扁桃体炎。像春秋季节，气温波动频繁，扁桃体炎的发病率会有所升高。