扁桃体发炎主要是由病原微生物感染引起的，其中细菌感染以A组乙型溶血性链球菌最为常见，病毒感染则以腺病毒较为多见。一般来说，当人体抵抗力下降时，如过度疲劳、受凉等，这些病原体就容易趁机侵入扁桃体引发炎症。
一、细菌感染引发扁桃体发炎
A组乙型溶血性链球菌感染：这种细菌常存在于人的咽部，当人体免疫力降低时，它就会大量繁殖，侵袭扁桃体，导致扁桃体发炎。比如在学校、幼儿园等人群密集场所，儿童之间相互接触，容易传播这种细菌从而引发扁桃体发炎。葡萄球菌感染：金黄色葡萄球菌等葡萄球菌也是导致扁桃体发炎的常见细菌之一。它可以通过空气飞沫传播或者直接接触传播，当接触到携带葡萄球菌的物品或人后，就可能感染扁桃体，引起炎症反应。
二、病毒感染引发扁桃体发炎
腺病毒感染：腺病毒是引起病毒性扁桃体炎的重要病原体。腺病毒可以通过呼吸道飞沫传播，在秋冬季节或者人员密集的环境中，很容易在人群中传播。儿童感染腺病毒后，常常会出现扁桃体发炎、发热、咳嗽等症状。EB病毒感染：EB病毒也可能引发扁桃体发炎，它主要通过唾液传播，比如一起吃饭、接吻等行为都可能传播EB病毒。感染EB病毒后，除了扁桃体发炎外，还可能出现发热、乏力、淋巴结肿大等表现。
三、其他因素诱发扁桃体发炎
免疫力低下：当人体的免疫力处于较低水平时，比如长期熬夜、营养不良、患有慢性疾病等情况，身体抵御病原体的能力下降，就更容易受到细菌和病毒的侵袭，从而引发扁桃体发炎。例如，长期熬夜的人，身体的免疫功能会受到影响，扁桃体发炎的几率就会增加。不良生活习惯：长期吸烟、酗酒会损害咽部黏膜，降低咽部的抵抗力，使扁桃体容易受到病原体的感染。另外，过度用嗓也可能对扁桃体造成损伤，增加发炎的风险。比如一些歌手、教师等长期用嗓的人群，相对来说扁桃体发炎的发生率可能会高一些。