阴茎长了小肉芽可能是尖锐湿疣、阴茎珍珠疹、扁平湿疣等疾病引起，也可能是正常的生理结构，需要及时就医，明确诊断后进行针对性治疗。以下是一些可能的处理方法：
1.就医检查：医生会进行详细的问诊和体格检查，以了解小肉芽的特点、生长情况、是否有瘙痒、疼痛等症状，并可能会进行一些实验室检查，如醋酸白试验、HPV检测等，以明确病因。
2.针对病因治疗：
尖锐湿疣：如果是尖锐湿疣，通常采用物理治疗，如激光、冷冻、电灼等，去除疣体。同时，可能需要使用抗病毒药物，如干扰素、咪喹莫特等，以减少复发。
阴茎珍珠疹：阴茎珍珠疹是一种良性病变，通常不需要治疗。如果患者有治疗需求，可以通过激光、冷冻等方法去除疣体。
扁平湿疣：扁平湿疣是二期梅毒的表现之一，需要进行驱梅治疗，即使用青霉素等抗生素进行治疗。
其他情况：如果小肉芽是正常的生理结构，如阴茎系带旁丘疹、皮脂腺异位症等，通常也不需要治疗。但如果患者有疑虑或影响生活，可以考虑手术切除。
3.注意事项：
治疗期间应避免性生活，以免传染给他人。
注意个人卫生，保持阴茎清洁干燥。
遵医嘱按时用药，定期复查，以确保治疗效果。
如果有其他性传播疾病的高危行为，应及时进行相关检查和治疗。
需要注意的是，以上内容仅供参考，具体治疗方法应根据个人情况和医生的建议进行选择。如果对阴茎上的小肉芽有疑虑，建议及时就医，以便获得更专业的建议和治疗。