肛门周围长小疙瘩的主要原因包括以下几点：
1.尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，主要通过性接触传播。初期为单个或多个散在的淡红色小丘疹，质地柔软，顶端尖锐，后逐渐增大增多，可呈乳头状、菜花状或鸡冠状。可伴有瘙痒、疼痛或性交出血等症状。可使用咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素酊等药物治疗，也可采用激光、冷冻、电灼等物理治疗方法。
2.外痔：是齿状线以下的痔外静脉丛扩大曲张所形成的柔软静脉团。常见于肛门缘，表面盖以皮肤，可以看见或摸到，排便或增加腹压时，内痔部分即能脱出肛外，颜色鲜红，便后可自行缩回。肛门局部有下坠或异物感，如有血栓形成，则有疼痛。可使用痔疮膏、痔疮栓等药物治疗，严重者需手术治疗。
3.肛周脓肿：是指肛管、直肠周围软组织内或其周围间隙内发生的急性化脓性感染，并形成脓肿。常见于肛门周围皮下脓肿，局部红肿、压痛，有时伴有全身发热。可使用抗生素控制感染，形成脓肿后需及时切开引流。
4.肛瘘：是肛管或直肠与肛周皮肤相通的肉芽肿性管道，由内口、瘘管、外口三部分组成。主要症状为反复自外口流出少量脓液，污染内裤；有时脓液刺激肛周皮肤，有瘙痒感。肛瘘不能自愈，必须手术治疗。
5.肛门湿疹：是一种常见的非传染性皮肤病，病变多局限于肛门周围皮肤，亦偶有蔓延至臀部、会阴及阴蒂，局部可出现红疹、红斑、糜烂、渗出、结痂、脱屑。伴有瘙痒，夜间尤甚。可使用糖皮质激素乳膏、炉甘石洗剂等药物治疗，注意保持局部清洁干燥，避免搔抓和热水烫洗。
6.其他：肛门周围长小疙瘩还可能与毛囊炎、皮脂腺囊肿、传染性软疣、肛管直肠癌等有关。
如果发现肛门周围长小疙瘩，建议及时就医，明确诊断，并在医生的指导下进行治疗。同时，要注意保持肛门局部清洁卫生，避免搔抓和摩擦，避免食用辛辣刺激性食物。