舌头根部溃疡可能是多种原因引起的，治疗方法因病因而异。以下是一些可能的治疗药物：
1.局部麻醉药物：可以缓解疼痛，如利多卡因凝胶。
2.糖皮质激素：具有抗炎作用，如泼尼松龙片。
3.免疫调节剂：调节免疫功能，如转移因子胶囊。
4.维生素类药物：补充维生素，如维生素B2、维生素C。
5.中药：具有清热解毒、活血化瘀等作用，如口腔溃疡散。
需要注意的是，以上药物应在医生的指导下使用，尤其是糖皮质激素和免疫调节剂，需要根据具体情况调整剂量和使用时间。同时，还应注意以下几点：
1.保持口腔卫生：使用软毛牙刷刷牙，饭后漱口，避免食物残渣残留。
2.饮食调整：避免辛辣、刺激性食物，多吃新鲜蔬菜和水果，补充维生素和矿物质。
3.避免刺激因素：如吸烟、饮酒、过热或过冷的食物等。
4.休息充足：保证充足的睡眠，避免熬夜和过度劳累。
5.心理调节：减轻压力，保持良好的心态。
如果舌头根部溃疡持续不愈、疼痛剧烈或伴有其他症状，如发热、淋巴结肿大等，应及时就医，进行进一步的检查和治疗。此外，特殊人群如孕妇、哺乳期妇女、儿童、老年人等，在使用药物时应更加谨慎，最好在医生的指导下使用。