三个月宝宝消化不良的症状主要有以下几个方面：
1.腹泻：粪便中有大量未消化的食物残渣，颜色发绿，次数增多。
2.腹胀：腹部胀满，叩之有声，有时还会出现呕吐。
3.食欲不振：宝宝不想吃奶，或者吃奶后容易哭闹、吐奶。
4.口臭：口中有酸腐味，这是因为食物在胃肠道内积滞时间过长，产生了浊气。
5.睡眠不安：宝宝睡眠时不踏实，经常翻动身体，有时还会哭闹。
6.皮肤问题：部分宝宝可能会出现湿疹、皮疹等皮肤问题。
如果宝宝出现了以上症状，家长可以采取以下措施：
1.调整饮食：如果是母乳喂养，妈妈要注意自己的饮食，避免吃辛辣、油腻、生冷的食物；如果是人工喂养，可以适当减少奶量，增加喂奶次数，或者将奶粉冲稀一些。
2.腹部按摩：以宝宝的肚脐为中心，顺时针方向轻轻按摩宝宝的腹部，促进肠道蠕动，帮助消化。
3.服用益生菌：益生菌可以调节肠道菌群，改善消化不良的症状。可以在医生的指导下给宝宝服用益生菌。
4.就医治疗：如果宝宝的症状比较严重，或者持续时间较长，家长应及时带宝宝就医，在医生的指导下进行治疗。
需要注意的是，三个月的宝宝消化系统还比较脆弱，家长在护理时要特别小心，避免给宝宝喂食过多、过杂的食物，同时要注意宝宝的保暖，避免着凉。如果宝宝出现发热、脱水等症状，应及时就医。