3岁宝宝半夜呕吐有馊味，可能是由于消化不良、饮食问题或其他健康问题引起。具体如下：
1.消化不良：如果宝宝晚餐吃了过多难以消化的食物，或者进食过快、过饱，都可能导致消化不良，引起呕吐并伴有馊味。此外，宝宝腹部受凉也可能导致胃肠功能紊乱，引起呕吐。
2.饮食问题：如果宝宝吃了变质的食物、过甜或过油腻的食物，也可能引起呕吐。
3.呼吸道感染：宝宝呼吸道感染时，可能会出现咳嗽、流涕等症状，咳嗽剧烈时可能导致呕吐，呕吐物也可能有酸味。
4.肠道感染：如宝宝患有肠炎、胃炎等肠道疾病，也可能出现呕吐、腹泻等症状，呕吐物可能有异味。
5.其他健康问题：宝宝患有肠梗阻、胆囊炎、胰腺炎等疾病时，也可能出现呕吐，且呕吐物有异味。
如果宝宝只是偶尔出现一次呕吐，且精神状态良好，可以先观察，让宝宝多喝水，避免脱水。如果宝宝呕吐频繁，或伴有其他症状，如发热、腹泻、腹痛、精神萎靡等，应及时就医，以便明确病因，并进行相应的治疗。
在日常生活中，家长应注意宝宝的饮食卫生，避免给宝宝吃变质的食物，每餐不要进食过多，尽量避免宝宝吃过于甜腻或油腻的食物。同时，要注意给宝宝保暖，避免腹部受凉。如果宝宝有呕吐症状，应及时清理呕吐物，保持口腔清洁。