月经过后三天同房是否会怀孕，不能一概而论，需要根据女性的月经周期、经期长短以及排卵情况等因素来综合判断。
一般来说，女性的排卵日通常在下次月经来潮前的14天左右，排卵日的前5天和后4天，连同排卵日在内共10天称为排卵期。在排卵期内同房，受孕的几率较高。如果女性的月经周期规律，经期较短（如2-3天），月经后三天可能已经进入排卵期，此时同房怀孕的几率较大。但如果女性的月经周期不规律，经期较长（如7-8天），或者存在排卵异常的情况，那么月经后三天同房怀孕的几率就较小。
此外，精子在女性体内可存活2-3天，卵子排出后可存活1-2天，因此，在排卵期前后同房，都有怀孕的可能。
需要注意的是，安全期避孕法并不十分可靠，因为女性的排卵可能会受到情绪、环境、健康状况等因素的影响而提前或推迟。如果没有怀孕的计划，建议在同房时采取有效的避孕措施，如使用避孕套、口服避孕药、放置宫内节育器等。
对于月经不规律的女性，或者存在排卵异常的情况，建议及时就医，进行相关的检查和治疗，以提高受孕的几率或避免意外怀孕。
总之，月经过后三天同房是否会怀孕，需要根据个人情况进行具体分析。如果担心怀孕，建议在同房后7-10天进行早早孕检测，或者在同房后10-14天进行血HCG检测，以明确是否怀孕。同时，建议在同房时注意个人卫生，避免感染。