停经43天做彩超未见孕囊，可能是以下原因导致的。
1.受孕时间较短：孕囊可能还未发育到可以在彩超中看到的大小。
2.宫外孕：受精卵着床在子宫以外的位置，如输卵管、卵巢等，此时彩超也可能看不到孕囊。
3.生化妊娠：精子和卵子结合形成受精卵，但没有成功在子宫着床，随后自然流产，这种情况下也可能检测不到孕囊。
4.胎停育：孕囊发育到一定阶段后停止发育，B超检查显示孕囊不完整、无胎心胎芽。
5.其他：如子宫畸形、子宫肌瘤等也可能影响孕囊的着床和发育。
需要注意的是，以上只是一些可能的原因，具体情况需要结合个人的具体情况和医生的进一步检查来确定。如果停经43天未见孕囊，医生可能会建议进行血液检查，如人绒毛膜促性腺激素（hCG）和孕酮的测定，以帮助判断是否怀孕。此外，还可能会进行其他检查，如阴道超声、腹腔镜等，以明确病因。
在等待检查结果和进一步治疗的过程中，患者应保持良好的心态，遵循医生的建议，注意休息和营养，避免剧烈运动和性生活。如果出现腹痛、阴道流血等异常情况，应及时就医。