发烧时眼睛疼痛可能由多种原因引起，以下是一些可能的原因：
1.感染：发烧是身体对感染的一种免疫反应。眼部感染，如结膜炎、角膜炎等，可能导致眼睛疼痛和发红。此外，全身性感染，如流感、肺炎等，也可能引起眼部不适。
2.病毒感染：某些病毒感染，如流感病毒、腺病毒等，可能导致眼部症状，包括眼睛疼痛、红肿和流泪。
3.细菌感染：细菌感染也可能引起眼部炎症，如麦粒肿（睑腺炎）、泪囊炎等，导致眼睛疼痛和肿胀。
4.免疫性疾病：自身免疫性疾病，如系统性红斑狼疮、类风湿关节炎等，有时会累及眼部，引起眼睛疼痛、红肿和视力问题。
5.眼部并发症：某些发烧相关的疾病，如猩红热、麻疹等，可能导致眼部并发症，如结膜炎、虹膜炎等，从而引起眼睛疼痛。
6.药物副作用：某些药物，如抗生素、抗抑郁药等，可能引起眼部不适，包括疼痛。
7.眼压升高：发烧可能导致身体的生理变化，包括眼压升高，从而引起眼睛疼痛。青光眼是一种可能导致眼压升高的眼部疾病，需要及时就医诊断和治疗。
8.三叉神经痛：三叉神经痛是一种面部神经痛，有时可能会引起眼部疼痛。
如果发烧时伴有眼睛疼痛，建议采取以下措施：
1.测量体温：密切关注体温变化，确保发烧得到适当的治疗。
2.眼部护理：保持眼部清洁，避免揉眼。使用温水清洗眼睛或使用人工泪液来缓解眼部不适。
3.就医咨询：如果眼睛疼痛严重、持续不缓解、伴有视力问题或其他异常症状，应及时就医。医生会进行详细的眼部检查和评估，确定病因并给予适当的治疗建议。
4.遵循医生建议：根据医生的诊断和治疗方案，按时服药、滴眼药水或进行其他治疗。
5.注意休息：确保充足的休息，避免过度用眼。
需要注意的是，每个人的情况可能不同，如果对发烧和眼睛疼痛的原因有疑虑，最好咨询医生以获得个性化的建议和诊断。此外，如果眼睛疼痛严重或伴有其他严重症状，应立即就医，以避免病情进一步恶化。