通常来说，小孩发烧若是生理性因素所致，那眼睛疼可能是由颅内压引起，属于正常现象；若发烧是因病毒感染引起，就可能是发烧引发的眼部病变，比如病毒性结膜炎等导致。患者往往需要及时到医院，明确病因后对症治疗。
一、颅内压增高：人出现发烧症状时，内部血管会处于扩张状态，这种情况下，颅内压会有一定程度的升高，进而致使患者出现眼睛疼痛症状。此类症状会随着发烧的痊愈而逐渐消失，通常患者只需针对发烧进行治疗即可。
二、病毒性结膜炎：一般而言，如果患者患的是病毒性发烧，可能会累及眼部，导致并发病毒性结膜炎。在此种情况下，患者需要及时前往医院，在医生指导下应用利巴韦林、氧氟沙星等药物进行治疗。
总之，小孩发烧后眼睛疼的原因不同，应对方法也不同，要准确判断并采取合适的治疗措施。