三个月婴儿拉肚子，可能是以下原因引起：
1.生理性稀便：由于三个月的婴儿月龄较小，其消化系统尚未发育完全，肠道内的乳糖酶含量较少，无法完全消化母乳或配方奶中的乳糖，就可能导致大便次数增多、大便稀薄。这种情况一般不需要特殊处理，随着婴儿的生长发育，消化系统逐渐完善，症状会逐渐缓解。
2.喂养不当：如果家长给婴儿喂食过多、过勤，或者喂食了不易消化的食物，就可能导致婴儿消化不良，出现拉肚子的症状。此外，如果家长没有注意给婴儿保暖，腹部受凉也可能导致肠蠕动加快，引起腹泻。这种情况下，家长可以通过调整喂养方式，如适量喂食、喂食易消化的食物等，来缓解婴儿的症状。同时，要注意给婴儿腹部保暖，避免着凉。
3.感染：如果婴儿的奶瓶、奶嘴等没有及时清洗消毒，或者家长在护理婴儿时没有注意卫生，就可能导致婴儿感染细菌、病毒等病原体，引起肠道炎症，出现拉肚子的症状。此外，婴儿如果接触了感染性腹泻的患儿，也可能被传染。这种情况下，家长需要及时带婴儿就医，在医生的指导下使用药物进行治疗。同时，要注意给婴儿补充水分，以免脱水。
4.其他：除了以上原因外，婴儿拉肚子还可能与乳糖不耐受、过敏等因素有关。
需要注意的是，如果婴儿拉肚子的症状持续时间较长或者伴有其他不适症状，如发热、呕吐、腹痛等，家长应及时带婴儿就医，以免延误病情。