宝宝三个月咳嗽喉咙里有痰，可采取以下措施：
1.增加空气湿度：使用加湿器可以增加空气湿度，缓解喉咙不适。
2.拍背排痰：让宝宝侧卧，家长五指微曲成半环状，即空心拳，然后轻轻拍打宝宝的前胸及侧胸背部，两侧交替进行，拍背力量不宜过大，由上而下，从外向内，依次进行。拍背能够帮助宝宝咳出喉咙里的痰。
3.多喝温水：多喝水可以帮助稀释痰液，促进痰液咳出。
4.就医治疗：如果宝宝咳嗽严重或持续时间较长，或者出现发热、呼吸急促等症状，应及时就医，以便医生根据具体情况进行治疗。
需要注意的是，宝宝咳嗽喉咙里有痰可能是由多种原因引起的，如感冒、肺炎等。在采取上述措施的同时，家长应密切观察宝宝的病情变化，如有必要，应及时就医。此外，三个月大的宝宝身体抵抗力较弱，家长应注意保持宝宝的个人卫生，勤洗手，避免带宝宝去人员密集的场所，以预防感染。