怀孕40天B超未见胎芽，可能是以下原因导致的：
1.实际怀孕时间较短：胎芽通常在怀孕6-7周时可以通过B超看到。如果月经周期不规律，或者排卵延迟，实际怀孕时间可能比停经时间短，导致B超未见胎芽。
2.胚胎发育异常：如果胚胎本身存在问题，如染色体异常或其他发育缺陷，可能会导致胎芽出现较晚或不出现。
3.子宫环境问题：子宫畸形、子宫内膜过薄或过厚、子宫肌瘤等子宫问题，可能会影响胚胎的正常发育。
4.激素水平不足：怀孕早期，孕激素和人绒毛膜促性腺激素水平对胚胎发育至关重要。如果激素水平不足，可能会导致胎芽发育缓慢或停滞。
5.其他因素：孕妇年龄较大、吸烟、饮酒、暴露于有害物质等，也可能增加胚胎发育异常的风险。
需要注意的是，B超未见胎芽并不一定意味着胚胎一定有问题。医生通常会建议在一周后复查B超，以确定胎芽的发育情况。如果一周后B超仍未见胎芽，或出现阴道流血、腹痛等异常情况，可能需要进一步检查，如血清孕酮、人绒毛膜促性腺激素测定、阴道超声等，以明确诊断。
对于怀孕40天B超未见胎芽的情况，孕妇应保持冷静，遵循医生的建议进行进一步的检查和观察。同时，要注意休息，避免劳累和剧烈运动，保持良好的心态，有助于胚胎的正常发育。如果有任何异常情况，应及时就医。