指甲凹凸不平可能是营养不良、真菌感染、扁平苔藓、银屑病甲等原因所致，可以通过调整饮食、药物治疗、物理治疗等方式进行改善，建议及时就医。具体分析如下：
1.营养不良：如果长期挑食、偏食，可能会导致体内缺乏维生素、微量元素等营养物质，从而影响指甲的正常生长，出现指甲凹凸不平、变薄、易碎等症状。患者可以通过调整饮食结构，多吃一些富含维生素、蛋白质的食物，如蔬菜、水果、鸡蛋、牛奶等，同时还可以遵医嘱服用多维元素片、维生素C咀嚼片等药物进行治疗。
2.真菌感染：如果指甲受到真菌感染，可能会导致指甲出现增厚、变色、凹凸不平等症状。患者可以在医生的指导下使用抗真菌药物进行治疗，如酮康唑乳膏、盐酸特比萘芬乳膏等。如果病情比较严重，还可以口服抗真菌药物，如伊曲康唑胶囊、氟康唑胶囊等。
3.扁平苔藓：扁平苔藓是一种皮肤黏膜慢性炎症性疾病，可能与免疫因素、感染因素、内分泌因素等有关。患者的指甲可能会出现甲板纵嵴、甲纵沟、甲分离等症状。患者可以在医生的指导下使用糖皮质激素、免疫抑制剂等药物进行治疗，如泼尼松龙片、他克莫司软膏等。
4.银屑病甲：银屑病是一种常见的慢性炎症性皮肤病，可能与遗传因素、环境因素、免疫因素等有关。患者的指甲可能会出现点状凹陷、甲板增厚、变色、畸形等症状。患者可以在医生的指导下使用角质促成剂、角质松解剂等药物进行治疗，如卡泊三醇软膏、他卡西醇软膏等。
患者在治疗期间需要注意保持指甲清洁卫生，避免长时间泡水，同时还可以适当食用一些富含蛋白质、维生素的食物，如鸡蛋、牛奶、苹果、香蕉等，避免食用辛辣、油腻、刺激性的食物，如辣椒、油炸食品、海鲜等。