先天性耳前瘘管主要通过手术治疗。一般确诊后，没有感染的耳前瘘管，建议在儿童期（通常3岁以上）进行手术切除，这样能降低日后感染的风险。
手术治疗时机
无症状时： 如果耳前瘘管没有任何感染发炎的症状，最好在学龄前（3 - 6岁左右）进行手术切除。此时孩子的身体对手术的耐受能力相对较好，而且能减少日后感染的几率。感染时： 当耳前瘘管发生感染，出现红肿、疼痛、化脓等情况时，需要先进行抗感染治疗。一般会使用抗生素控制炎症，等感染得到控制，红肿消退后，再考虑手术切除。通常感染控制后2 - 3个月左右可以安排手术。
手术方式
单纯瘘管切除术： 适用于瘘管较单纯，没有复杂分支的情况。医生会沿着瘘管的走行，将瘘管及其周围的囊壁完整切除，这种手术创伤相对较小，恢复也比较快。瘘管切除加植皮术： 如果耳前瘘管感染后形成较大的创面，或者有较多的瘢痕组织，单纯切除瘘管后创面较大难以愈合，可能需要在切除瘘管后进行植皮手术。通过移植皮肤来覆盖创面，促进伤口愈合。
术后注意事项
伤口护理： 术后要保持伤口清洁干燥，按照医生的要求定期换药。一般术后7 - 10天左右拆线。如果是植皮的情况，要注意植皮部位的固定，避免植皮片移位。饮食注意： 术后饮食要清淡，多吃富含蛋白质和维生素的食物，如鸡蛋、牛奶、新鲜的蔬菜水果等，有助于伤口愈合。避免吃辛辣、刺激性食物，如辣椒、花椒等，防止刺激伤口，引起疼痛或加重炎症反应。预防感染： 术后要注意预防感冒，因为感冒咳嗽可能会导致伤口受到牵扯，影响愈合。同时，要避免耳朵进水，洗头、洗澡时可以用棉球堵住外耳道，防止污水进入引起感染。