男性肛瘘的原因主要包括以下几个方面：
1.感染：肛瘘多数是由于肛管直肠周围脓肿破溃后形成的，脓肿逐渐缩小，但肠内容物仍不断进入脓腔，在愈合缩小的过程中，常形成迂曲的腔道，引流不畅不易愈合，日久后腔道周围有许多疤痕组织，形成慢性感染性管道。
2.肛周脓肿：据近年来的研究表明，肛周脓肿是肛瘘的主要原因之一。
3.直肠肛门损伤：来自消化道的骨性异物、金属、肛表及肛门窥器等损伤肛管直肠，细菌侵入伤口即可引起肛周脓肿，不及时治疗，都可导致肛瘘。
4.肛裂：肛裂反复感染也可并发皮下瘘。
肛瘘的治疗方法主要包括以下几种：
1.挂线疗法：是利用橡皮筋或有腐蚀作用的药线的机械性压迫作用，缓慢切开肛瘘的方法。此法还具有操作简单、出血少、换药方便，在橡皮筋脱落前不会发生皮肤切口黏合等优点。
2.肛瘘切除术：切开瘘管并将瘘管壁全部切除至健康组织，创面不予缝合；若创面较大，可部分缝合，部分敞开，用红油膏纱条引流。
患者在治疗期间需要注意以下几点：
1.建立正常的膳食习惯，因肛瘘的发生与湿热有关，对于油腻饮食，可以内生湿热，所以不宜多吃。
2.应多吃清淡含丰富维生素的食物，如绿豆、萝卜、冬瓜等新鲜蔬菜、水果。
3.对经久不愈的肛瘘多为虚证，饮食上多吃含蛋白质类食品，如瘦肉、牛肉、蘑菇等。
4.及时治疗肛隐窝炎和肛乳头炎，以避免发展成肛瘘。
5.肛门灼热不适、肛门下坠者，要及时查清原因，及时治疗。
6.防治便秘和腹泻，对预防肛管直肠周围脓肿有重要意义，因为大便干结容易擦伤肛窦，再加上细菌侵入而感染。腹泻者多半有直肠炎和肛窦炎的存在，可使炎症进一步发展。