先天性甲状腺功能低下症是由于甲状腺激素合成不足或分泌缺陷所导致的疾病，主要治疗方法如下：
1.左旋甲状腺素钠替代治疗：是先天性甲状腺功能低下症的主要治疗方法。通过服用左旋甲状腺素钠，补充体内甲状腺激素的不足，维持正常的甲状腺功能。治疗剂量应根据患儿的年龄、体重、甲状腺功能等因素进行个体化调整。
2.定期监测甲状腺功能：治疗期间需要定期监测甲状腺功能，以调整左旋甲状腺素钠的剂量，确保甲状腺功能处于正常范围。
3.饮食调整：部分先天性甲状腺功能低下症患儿可能存在碘缺乏，需要适当增加碘的摄入。
4.其他治疗：对于一些合并其他疾病的患儿，可能需要同时进行相应的治疗，如先天性心脏病的治疗。
需要注意的是，先天性甲状腺功能低下症的治疗需要在医生的指导下进行，家长应按时带患儿复诊，以便医生根据患儿的病情调整治疗方案。同时，患儿在治疗期间应注意饮食、休息，避免感染等。