凌晨咳嗽厉害的原因可能有很多，以下是一些常见的原因：
1.咳嗽变异性哮喘：这是一种特殊类型的哮喘，主要表现为刺激性干咳，通常在夜间或凌晨发作。咳嗽变异性哮喘的诊断需要结合临床表现、肺功能检查和气道反应性测定等。
2.鼻后滴注综合征：鼻腔分泌物倒流刺激咽喉部可引起咳嗽，常伴有鼻塞、流涕等症状。
3.胃食管反流病：胃酸反流刺激食管和咽喉部可导致咳嗽，常伴有烧心、反酸等症状。
4.慢性阻塞性肺疾病：多见于长期吸烟或有慢性咳嗽病史的患者，可出现慢性咳嗽、咳痰、呼吸困难等症状。
5.心功能不全：左心功能不全时，肺循环淤血，可导致咳嗽，多在夜间平卧时发作，坐位或立位时减轻。
6.其他原因：如变应性咳嗽、嗜酸性粒细胞性支气管炎、上气道咳嗽综合征、药物相关性咳嗽等。
如果凌晨咳嗽厉害，持续时间较长或伴有其他症状，建议及时就医，进行相关检查，如血常规、胸片或CT、肺功能、气道反应性测定等，以明确病因，并在医生的指导下进行治疗。同时，应注意休息，避免劳累和受凉，避免接触过敏原，戒烟戒酒，保持室内空气流通。
对于儿童、老年人、孕妇等特殊人群，凌晨咳嗽厉害可能会影响睡眠和生活质量，甚至对健康造成更大的影响。因此，这些人群如果出现咳嗽症状，应更加重视，及时就医，以便得到更专业的治疗和建议。此外，一些慢性疾病患者，如慢性阻塞性肺疾病、支气管扩张等，咳嗽症状可能会加重，需要定期随访和治疗。
总之，凌晨咳嗽厉害可能是多种疾病的表现，需要根据具体情况进行综合分析和诊断。及时就医、明确病因、针对性治疗是关键。同时，保持良好的生活习惯和健康的生活方式也有助于缓解咳嗽症状。