关元是人体重要穴位，一天中按摩关元的时间并没有严格统一的规定，但一般来说，清晨起床后和晚上睡觉前相对较为适宜。
清晨起床后按摩关元
清晨人体经过一夜休息，气血开始复苏，此时按摩关元有助于激发阳气，促进一天的气血运行。可以在洗漱完毕后，取舒适体位，用掌根轻轻按揉关元穴，每次按揉10 - 15分钟左右，能开启活力，为一天的身体机能运转助力。
晚上睡觉前按摩关元
晚上睡觉前按摩关元，有助于放松身心，促进睡眠。在睡前半小时左右，平卧床上，将双手搓热后，以关元穴为中心进行环形按摩，约10 - 15分钟，可帮助调节脏腑功能，使身体更好地进入休息状态。不过，对于睡眠较浅或有睡眠障碍的人群，按摩力度要适中，避免过于兴奋影响入睡。
饭后不宜立即按摩关元
饭后胃肠处于消化蠕动状态，立即按摩关元可能会影响胃肠的正常消化功能，一般建议饭后1 - 2小时再进行关元穴的按摩，给胃肠消化留出一定时间。
特殊人群需谨慎
孕妇应避免按摩关元穴，因为关元穴有一定的刺激子宫的作用，可能会引起宫缩等情况，对胎儿造成不良影响；对于体质虚弱、容易疲劳的人群，按摩关元穴时要注意力度和时间，避免过度刺激导致身体不适；而对于患有严重心脑血管疾病等基础疾病的人群，按摩关元穴前最好咨询医生意见，确保按摩安全。