婴儿川崎病的病因目前尚未完全明确，但研究发现可能与多种因素有关。目前认为，婴儿川崎病可能是由感染因素引发的，比如某些病毒感染，像逆转录病毒、金黄色葡萄球菌等病原体感染可能与之相关。不过具体确切病因还在持续研究中。
感染因素相关情况
病毒感染方面： 有研究显示，多种病毒可能参与其中，比如 Epstein - Barr 病毒等，这些病毒感染后可能会引发婴儿机体的免疫反应异常，从而增加川崎病的发病风险。细菌感染方面： 金黄色葡萄球菌等细菌感染也被推测可能与川崎病的发生存在关联，细菌感染后刺激机体的免疫系统，导致免疫调节紊乱，进而可能诱发川崎病。
免疫因素相关情况
免疫异常反应： 婴儿自身的免疫系统可能出现异常激活的情况。正常情况下，免疫系统会精准识别和应对外来病原体，但在川崎病患儿体内，免疫系统会过度活化，产生大量的炎症因子等，导致血管炎症反应，累及全身中小动脉，尤其是冠状动脉。遗传易感性： 有一定的遗传倾向，研究发现某些基因的突变或多态性可能会使婴儿更容易患上川崎病。比如一些与免疫调节相关的基因，如果存在特定的变异，就可能影响机体对感染等因素的免疫应答，增加川崎病发病几率。
其他可能相关因素
环境因素： 环境中的某些因素也可能起到一定作用，比如空气污染等。长期暴露在污染的空气环境中，可能会对婴儿的呼吸道等造成刺激，进而影响机体的免疫状态，增加川崎病发病风险。个体差异： 婴儿个体之间存在差异，比如不同的体质、营养状况等，也可能与川崎病的发生有关。营养不均衡等情况可能会影响婴儿的免疫系统功能，使婴儿更容易受到各种致病因素的影响而患上川崎病。