怀孕42天B超看不到孕囊，可能是以下原因导致的：
1.怀孕时间较短：孕囊可能还没有发育到可以通过B超检测到的大小。通常，怀孕42天孕囊的平均直径约为6-7mm。如果平时月经周期较长或不规律，排卵和受精时间较晚，孕囊可能会更小，B超就可能无法看到。
2.宫外孕：受精卵在子宫体腔以外的部位着床发育，称为宫外孕。宫外孕时，孕囊无法在子宫内正常生长，B超也无法看到孕囊。宫外孕是一种危险的情况，可能会导致大出血等并发症，需要及时就医。
3.生化妊娠：指发生在妊娠5周内的早期流产，血中可以检测到HCG升高，大于25mlU/mL或者尿妊娠试验阳性，但超声检查看不到孕囊，提示受精卵着床失败。
4.胚胎发育不良：如果孕囊的发育存在问题，如染色体异常或其他遗传因素，可能会导致胚胎发育缓慢或停滞，B超也无法看到孕囊。
5.其他因素：子宫肌瘤、子宫畸形等子宫疾病，或者服用某些药物（如避孕药），也可能影响孕囊的发育和B超检测。
需要注意的是，以上只是一些可能的原因，具体情况需要结合个人的具体情况和医生的进一步检查来确定。如果怀孕42天B超看不到孕囊，医生可能会建议进行以下检查：
1.血HCG和孕酮检测：可以了解孕激素水平，判断孕囊的发育情况。
2.复查B超：通常会在一周后复查，以确定孕囊的位置和大小。
3.其他检查：根据具体情况，可能还需要进行其他检查，如宫腔镜、腹腔镜等，以排除其他潜在的问题。
在等待检查和结果的过程中，孕妇应保持冷静，避免过度紧张和焦虑。同时，要注意休息，避免剧烈运动和性生活。如果出现阴道流血、腹痛等异常情况，应及时就医。
如果最终确诊为宫外孕或其他异常情况，医生会根据具体情况制定相应的治疗方案，可能包括手术或药物治疗。如果孕囊发育正常，孕妇可以继续妊娠，但需要定期进行产前检查，确保胎儿的健康。
总之，怀孕42天B超看不到孕囊并不一定意味着有问题，但需要引起重视。及时就医，进行详细的检查和咨询，以便采取适当的措施。