双歧杆菌三联和四联的区别主要在于所含的菌种和功效上。
双歧杆菌三联活菌散包含长型双歧杆菌、嗜酸乳杆菌和粪肠球菌三种菌种，主要用于治疗肠道菌群失调引起的腹泻、便秘、功能性消化不良等。双歧杆菌四联活菌片包含双歧杆菌、嗜酸乳杆菌、粪肠球菌和蜡样芽孢杆菌四种菌种，除了治疗上述病症外，还能补充人体正常生理细菌，调整肠道菌群平衡，抑制并清除肠道中对人体具有潜在危害的菌类。
此外，双歧杆菌三联和四联的用法用量也有所不同，具体应根据患者的病情和年龄在医生的指导下选择合适的药物和剂量。
需要注意的是，双歧杆菌制剂为活菌制剂，切勿将其置于高温环境，溶解时水温也不宜过高，以免影响药效。对双歧杆菌三联和四联任一成分过敏者禁用，过敏体质者慎用。同时，在服用双歧杆菌制剂时，应避免与抗菌药物同时服用，如需使用，应间隔2~3小时。如果服用后出现严重的不适症状，应及时就医。此外，孕妇和哺乳期妇女在使用双歧杆菌制剂前也应咨询医生的意见。