屁眼疼可能由多种原因引起。比如肛裂，这是常见原因之一，通常是因为大便干结，排便时过度用力撑裂肛管皮肤，会有明显的疼痛，尤其是在排便时和排便后，还可能伴有便血。
痔疮导致的屁眼疼
内痔脱出嵌顿： Ⅱ度以上的内痔可能会脱出肛门外，若不能及时回纳，就会肿胀、疼痛，严重时会形成血栓，疼痛会加剧。外痔发炎： 结缔组织外痔一般不会疼，但炎性外痔会出现肛门部肿物疼痛，走路、坐下等都会受影响，局部有红肿、灼热感。
肛周脓肿引发的屁眼疼
低位肛周脓肿： 主要表现为肛门周围持续性疼痛，开始时是胀痛，之后逐渐加重为跳痛，病变处明显红肿，有硬结和压痛。高位肛周脓肿： 全身症状相对明显，如发热、寒战、乏力等，局部疼痛相对不那么典型，可能仅表现为直肠坠胀感。
肛门直肠炎症造成的屁眼疼
溃疡性结肠炎： 除了有腹泻、黏液脓血便外，病变累及肛门时会出现肛门坠胀、疼痛，还可能伴有里急后重感。直肠炎： 急性直肠炎发作时，肛门部有灼热感、疼痛，还可能有排便不尽感，慢性直肠炎则症状相对较轻，但也会有间断的肛门不适疼痛。