健康证肛门检查主要是检查是否有影响食品、饮用水等行业工作的传染病，包括寄生虫、细菌、病毒等。具体检查项目如下：
1.医生观察肛门周围是否有伤口、红肿、皮疹等异常情况。
2.进行直肠指诊，医生戴上手套，用食指伸进肛门，触摸肠道是否有肿块、硬结或压痛。
3.采集粪便样本，用于检查是否有寄生虫、细菌或病毒感染。
4.可能会进行其他检查，如肛门镜检查或结肠镜检查，以更深入地观察肠道内部情况。
需要注意的是，肛门检查可能会引起一些不适，但通常是可以忍受的。在检查前，医生会告知你注意事项，并在检查过程中给予适当的指导和安慰。如果你对肛门检查有任何疑问或担忧，应及时与医生沟通。